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如何應對細胞株系開發數據挑戰

來源: 貝克曼庫爾特商貿(中國)有限公司    2020年10月24日 14:18  

細胞株開發是眾多具有重大數據挑戰的工作流程之一。與任何篩選過程一樣,樣本通量帶來了數據量的挑戰。當使用多種分析工具以不同格式生成不同類型的數據時,這就變得更加具有挑戰性。這不僅需要在不同的孔板和孔之間移動數據,而且整個過程可能會延長數月。在整個過程中,必須對數據進行追蹤,以確保進入生產的任何細胞株都有必要的歷史數據(例如單克隆性的證明),并且為了報告需要,所有的數據都可以被方便地訪問。在這里,我們將描述在Biomek i7工作站上自動化細胞株開發如何克服與此工作流程相關的許多數據挑戰。

Biomek i7工作站與三方設備整合一起被用于自動化細胞株開發工作流程。

作為液體轉移步驟的一部分,Biomek軟件會自動移動數據,因此數據可以隨著樣本移動而并行移動(圖4)。同時,數據也可以存儲在DART數據庫中,未來任何時候掃描孔板條碼時,相應的數據都會被自動檢索出來。DART提供了不同時間交互的方法之間的鏈接(圖4)——在諸如細胞株開發這樣的長時間工作流程中,這是一個關鍵組件。

圖3:自動化數據處理示意圖。

除開存儲和利用數據,DART數據庫可以通過多種方便的方式訪問。為了以用戶友好的方式進行快速可視化,可通過Chrome瀏覽器直接實時查看(圖6A),同時可以使用DART報告生成器在Excel中生成報告。

圖6:DART數據查看和報告。

在任何實驗中產生的數據使實驗有價值。數據處理中的任何錯誤都可能消除這個價值,甚至可能將研究進程推向錯誤的方向。對于像細胞株開發這樣長達數月的工作流程,數據丟失或錯誤的風險更大,因此,確保數據完整性的工具至關重要。Biomek和DART軟件通過使數據完整性過程自動化且易于獲取,可以為細胞株開發過程提供真正的價值。

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