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數顯冷凍干燥機使用的干燥方法是凍干法。凍干法是在0℃以下進行，即在產品凍結的狀態下進行，只在后期降低產品的殘余水份含量時，才讓產品升至0℃以上的溫度，但一般不超過40℃。在真空條件下，當水蒸汽直接升華出來后，藥物剩留在凍結時的冰架中，形成類似海綿狀疏松多孔架構，因此它干燥后體積大小幾乎不變。再次使用前，只要加入注射用水，又會立即溶解。
干燥是非常古老的操作,但粉體和生物制品的加熱干燥常常造成顆粒不可復原的團聚,尤其是在超細粉體制備方面,液相中的納米顆粒經干燥會聚結為難以分散的團塊,這主要是因為普通的顆粒干燥過程中水分在從顆粒間孔道散發,表面張力導*高的附加壓力,將顆粒緊壓在一起成為團塊。
而冷凍干燥可以避免這一問題,冷凍干燥是先將待干燥凝膠或血液冷凍為固體,再在合理的條件先通過升華作用而使其中的水分氣化而脫除水分,由于冰的氣化過程不會對固體顆粒的聚結狀態產生影響,因此可以完好保存原來的顆粒不被壓緊而團聚,此外冷凍干燥非常適合處理生物制品,比如血液等,因為它沒有高溫操作,可以防止生物制品變質。
影響數顯冷凍干燥機能耗的因素，主要有如下三個：
1、來自物料的影響：如共晶點、熱敏感程度、幾何尺寸大小或厚薄等對所需要的干燥時間長短，運行成本都會產生較大影響；
2、所采用的工藝路線的影響：如對物料的凍結終溫、凍結速率、加熱溫度、升溫速率及時機的確定和把握等都會對干燥速度和運行成本產生影響。
3、數顯冷凍干燥機本身的影響：冷凍干燥機的性能、極限參數指標、綜合能力、能源利用率、運行穩定性、操控難易程度等都會對干燥效率和運行成本產生影響，甚至嚴重影響。
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