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菌落計數是微生物實驗中普遍實驗之一，是統計物品含菌數的有效方法，廣泛用于食品、飲料、藥品、生物制品、化妝品、衛生用品、飲用水、生活污水、工業廢水、臨床標本中細菌數的檢驗。菌落計數器是一種數字顯示式自動細菌檢驗儀器，能夠幫助實驗人員對菌落進行計數，由計數器、探筆、計數池等部分組成，計數器采用CMOS集成電路精心設計，LED數碼管顯示，清晰明亮，配合專用探筆，計數靈敏準確。
菌落計數器/分析儀廣泛應用于食品和飲料的品質和衛生檢驗、水質分析、乳及乳制品的檢測、醫院臨床檢驗、化妝品檢驗和藥品的品質和質量檢測等等，適用于對微生物的菌落計數和計算、抗生素的抗菌性測試和菌種篩選等。
菌落計數器的維護保養：
1.儀器應放置在平整牢固的實驗臺上使用；
2.點數菌落時，計數筆不要過于傾斜，輕輕點下至有彈跳感，聽到“嘟”聲即可，如點按過重，易損壞計數筆；
3.儀器應防潮、防劇烈震動、防直接日光暴曬、防細菌污染計數池，用后應加防塵罩；
4.注意防止細菌污染計數池；
5.及時檢查菌落計數器計數筆有無墨水，如無墨水，應進行更換。
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